Тази година Nintendo нямаха истинска пресконференция на E3, а разпространиха видео стриим, чрез Nintendo Direct. Видеото се водеше от Satoru Iwata - президент на Nintendo Corporation. Бяха представени игрите, които предстои да излязат на пазара до края на годината и в началото на следващата. Стриима започна с играта Pokemon за Nintendo 3DS. След това бяха излъчени трейлъри на ексклузивите за Nintendo Wii U - Super Mario 3D World (ще се появи през декември), The Legend Of Zelda: the Wind Waker HD (oктомври), Mario Kart 8 (пролетта на 2014-та), Wii Party U и Wii Fit U (тази зима). Освен това ще има и нова версия на Super Smash Bros за 3DS и Wii U, която ще излезне през пролетта на 2014 г. Също така ще има и нов Donkey Kong.
Останалите по интересни игри са Assasin's Creed 4, Watch Dogs, Rayman Origins, новия Batman, като прави впечатление, че вече окончателно е потвърдено, че GTA 5 няма да излезне за Wii U.